به طور کلی دو هدف عمده برای استفاده از تلقیح مصنوعی در طرح ملی اصلاح نژاد گوسفند و بز کشور وجود دارد.

1- ثبت دقیق شجره : درطرح محوری به علت مشکلات پیش آمده، جفت گیری شده عملا متوقف شده بود درحالی که درصورت استفاده از تلقیح مصنوعی چون دام ماده در زمان خاص تلقیح می شود و ثبت تلقیح نیز به راحتی توسط تیم مربوطه امکان پذیر است، پدر و مادر هر بره یا بزغاله به طوردقیق مشخص می گردد.

2- اتصال ژنتیکی بین گله های مختلف: حتی درصورتی که شجره ها کامل و دقیق ثبت شوند مقایسه بین دامهای گله های مختلف از نظر یافته های جدید اصلاح نژادی فقط وقتی امکان پذیراست که به نحوی بین آن گله ها اتصال ژنتیکی وجود داشته باشد. با تکنیک تلقیح مصنوعی می توان ازطریق تزریق اسپرم چند قوچ یا بز نر مشترک درگله های مختلف اتصال ژنتیکی لازم رابین آنها برقرار کرد.

علاوه برموارد فوق که دلایل اصلی استفاده از تکنیک تلقیح مصنوعی درطرح ملی اصلاح نژاد گوسفند و بز به شمار می روند تلقیح مصنوعی گوسفند و بز مزایای قابل توجه بسیاری نیز دارد که اهم آنها عبارتند از:   

-  همزمان کردن فحلی دامهای ماده مولد و بهترکردن شرایط مدیریتی با تولد همزمان نتاج.

-  ازدیاد نتاج قوچ ها و بزهای نر برتر.

-  ایجاد امکان پروژنی تست دامهای نر (آزمون نتاج).

-  ایجاد امکان استفاده از اسپرم دامهای نر ممتازی که گله دار توان خرید خود آنها را ندارد .

- کاستن از تعداد دامهای نر و در نتیجه صرفه جویی در هزینه ها.

- شناسائی و کنترل بیماریهای مختلف دستگاه تناسلی دامهای نر و ماده.

- سرعت بخشیدن به عملیات اصلاح نژادی با شناسائی دامهای نر ممتاز و توزیع  وسیع اسپرم آنها درگله های مختلف.

- ایجاد امکان بره زائی در خارج از فصل.

- ایجاد امکان بره زائی بیش از یکبار در سال.

- ایجاد امکان تنظیم تاریخ زایش با مسائل گوناگون مثل وضعیت بازار، وضعیت مراتع و...

- ایجاد بانک ژن با انجماد و نگهداری اسپرم دامهای نر ممتاز.

- افزودن بر عمر اقتصادی دامهای نر ممتاز با انجماد و نگهداری اسپرم آنها به مدت طولانی.

- کم کردن فاصله سنی بره ها برای سهولت پرورش آنها.

- ایجاد زمینه های اشتغال مناسب و مفید با ایجاد مراکز تلفیح مصنوعی و خدمات اصلاح نژادی گوسفند و بز برای فارغ التحصیلان رشته علوم  دامی.